Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC23AQ15436 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC23AQ15436 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC23AQ15436 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms