Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP1Q13829 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms