Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROAPQ12815 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROAPQ12815 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROAPQ12815 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TROAPQ12815 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TROAPQ12815 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TROAPQ12815 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROAPQ12815 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms