Protein–RNA interactions for Protein: Q03957

CTK1, CTD kinase subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTK1Q03957 RPT1YKL145W 1404 nt5.4□□□□□ -1.54
CTK1Q03957 PRR2YDL214C 2100 nt5.4□□□□□ -1.54
CTK1Q03957 CHO1YER026C 831 nt5.4□□□□□ -1.54
CTK1Q03957 YLR194CYLR194C 765 nt5.4□□□□□ -1.54
CTK1Q03957 CKB2YOR039W 777 nt5.4□□□□□ -1.54
CTK1Q03957 PRD1YCL057W 2139 nt5.4□□□□□ -1.54
CTK1Q03957 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt5.4□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt5.4□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YME1YPR024W 2244 nt5.4□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 KCH1YJR054W 1494 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 GUA1YMR217W 1578 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YDL183CYDL183C 963 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 COG7YGL005C 840 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 TIM21YGR033C 720 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 GRE3YHR104W 984 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 MTR2YKL186C 555 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 RDL2YOR286W 450 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 ECM8YBR076W 1065 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 MLC2YPR188C 492 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 DEG1YFL001W 1329 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 DBP9YLR276C 1785 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 BRL1YHR036W 1416 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 MTC1YJL123C 1437 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 VNX1YNL321W 2727 nt5.39□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 PRP19YLL036C 1512 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 STE12YHR084W 2067 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 ATR1YML116W 1629 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 AIM6YDL237W 1173 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 UBC5YDR059C 447 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 RML2YEL050C 1182 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 ERG25YGR060W 930 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YHB1YGR234W 1200 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YAL066WYAL066W 309 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 SPC3YLR066W 555 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 EMG1YLR186W 759 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 SUB2YDL084W 1341 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 MCM6YGL201C 3054 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YLR345WYLR345W 1530 nt5.38□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 IMA2YOL157C 1770 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 GUP2YPL189W 1830 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YCR100CYCR100C 951 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 NUP42YDR192C 1293 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 ASP1YDR321W 1146 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 RSM26YJR101W 801 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 PCD1YLR151C 1023 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 NIT3YLR351C 876 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YNL217WYNL217W 981 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 TIF5YPR041W 1218 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 DUG1YFR044C 1446 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YMR155WYMR155W 1644 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 ATP1YBL099W 1638 nt5.37□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 PAD1YDR538W 729 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YHL044WYHL044W 708 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 RHO3YIL118W 696 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 SYN8YAL014C 768 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 ORM2YLR350W 651 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 HEK2YBL032W 1146 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 FAR3YMR052W 615 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YNL174WYNL174W 573 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 TEX1YNL253W 1269 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 SMA1YPL027W 738 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 snR19snR19 568 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 CHL4YDR254W 1377 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 SLM5YCR024C 1479 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YEH1YLL012W 1722 nt5.36□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 HIR1YBL008W 2523 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 CLP1YOR250C 1338 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 RNH202YDR279W 1053 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 ALB1YJL122W 528 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 SFH5YJL145W 885 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 ELA1YNL230C 1140 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 PFA3YNL326C 1011 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 GLO4YOR040W 858 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 SPS4YOR313C 1017 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YOR342CYOR342C 960 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YAP1801YHR161C 1914 nt5.35□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 BUL1YMR275C 2931 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 IDP1YDL066W 1287 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 IPK1YDR315C 846 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 COS4YFL062W 1140 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YGL072CYGL072C 360 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 HPM1YIL110W 1134 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 YLR374CYLR374C 390 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 CSM3YMR048W 954 nt5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.2 ms