Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC6A3Q01959 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms