Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBXN2AP68543 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms