Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP4P57796 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP4P57796 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP4P57796 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP4P57796 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP4P57796 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP4P57796 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP4P57796 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP4P57796 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP4P57796 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP4P57796 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP4P57796 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP4P57796 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP4P57796 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP4P57796 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP4P57796 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP4P57796 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP4P57796 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP4P57796 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP4P57796 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP4P57796 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP4P57796 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP4P57796 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP4P57796 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP4P57796 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP4P57796 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP4P57796 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP4P57796 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP4P57796 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP4P57796 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP4P57796 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP4P57796 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP4P57796 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP4P57796 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP4P57796 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP4P57796 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP4P57796 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP4P57796 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP4P57796 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP4P57796 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP4P57796 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP4P57796 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP4P57796 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP4P57796 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP4P57796 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP4P57796 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP4P57796 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP4P57796 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP4P57796 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP4P57796 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP4P57796 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP4P57796 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP4P57796 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP4P57796 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP4P57796 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP4P57796 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP4P57796 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP4P57796 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP4P57796 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP4P57796 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP4P57796 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CABP4P57796 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CABP4P57796 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CABP4P57796 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CABP4P57796 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CABP4P57796 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CABP4P57796 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CABP4P57796 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CABP4P57796 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CABP4P57796 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CABP4P57796 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CABP4P57796 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CABP4P57796 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CABP4P57796 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CABP4P57796 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CABP4P57796 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CABP4P57796 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CABP4P57796 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CABP4P57796 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CABP4P57796 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms