Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB38P57729 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB38P57729 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB38P57729 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB38P57729 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB38P57729 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB38P57729 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB38P57729 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB38P57729 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB38P57729 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB38P57729 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB38P57729 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB38P57729 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB38P57729 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB38P57729 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB38P57729 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB38P57729 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB38P57729 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB38P57729 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB38P57729 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB38P57729 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB38P57729 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB38P57729 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB38P57729 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB38P57729 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB38P57729 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB38P57729 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB38P57729 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB38P57729 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB38P57729 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB38P57729 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB38P57729 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB38P57729 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB38P57729 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB38P57729 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB38P57729 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB38P57729 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB38P57729 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB38P57729 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB38P57729 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB38P57729 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB38P57729 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB38P57729 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB38P57729 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB38P57729 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB38P57729 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB38P57729 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB38P57729 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB38P57729 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB38P57729 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB38P57729 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB38P57729 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB38P57729 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB38P57729 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB38P57729 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB38P57729 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB38P57729 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB38P57729 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB38P57729 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB38P57729 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB38P57729 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB38P57729 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB38P57729 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB38P57729 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms