Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBASH3AP57075 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms