Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB3P54284 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CACNB3P54284 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB3P54284 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms