Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX2-5P52952 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKX2-5P52952 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKX2-5P52952 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms