Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA3P51805 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms