Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ1P51787 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ1P51787 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ1P51787 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ1P51787 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNQ1P51787 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNQ1P51787 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms