Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRE11P49959 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRE11P49959 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MRE11P49959 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRE11P49959 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRE11P49959 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRE11P49959 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRE11P49959 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRE11P49959 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRE11P49959 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRE11P49959 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRE11P49959 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRE11P49959 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MRE11P49959 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRE11P49959 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRE11P49959 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRE11P49959 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRE11P49959 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRE11P49959 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRE11P49959 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRE11P49959 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRE11P49959 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRE11P49959 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MRE11P49959 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRE11P49959 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRE11P49959 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRE11P49959 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MRE11P49959 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRE11P49959 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRE11P49959 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRE11P49959 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRE11P49959 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRE11P49959 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRE11P49959 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRE11P49959 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRE11P49959 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRE11P49959 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRE11P49959 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRE11P49959 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRE11P49959 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRE11P49959 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRE11P49959 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRE11P49959 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRE11P49959 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRE11P49959 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRE11P49959 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRE11P49959 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRE11P49959 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRE11P49959 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRE11P49959 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRE11P49959 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRE11P49959 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRE11P49959 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRE11P49959 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRE11P49959 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRE11P49959 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRE11P49959 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRE11P49959 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRE11P49959 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRE11P49959 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRE11P49959 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRE11P49959 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRE11P49959 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRE11P49959 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRE11P49959 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRE11P49959 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRE11P49959 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRE11P49959 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRE11P49959 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRE11P49959 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRE11P49959 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRE11P49959 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRE11P49959 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRE11P49959 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRE11P49959 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRE11P49959 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRE11P49959 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MRE11P49959 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRE11P49959 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRE11P49959 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRE11P49959 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MRE11P49959 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRE11P49959 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRE11P49959 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRE11P49959 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRE11P49959 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRE11P49959 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRE11P49959 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRE11P49959 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRE11P49959 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRE11P49959 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRE11P49959 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRE11P49959 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRE11P49959 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRE11P49959 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRE11P49959 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRE11P49959 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRE11P49959 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRE11P49959 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRE11P49959 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms