Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PXNP49023 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PXNP49023 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PXNP49023 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PXNP49023 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PXNP49023 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PXNP49023 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PXNP49023 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PXNP49023 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PXNP49023 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PXNP49023 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PXNP49023 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PXNP49023 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PXNP49023 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PXNP49023 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PXNP49023 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PXNP49023 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PXNP49023 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PXNP49023 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PXNP49023 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PXNP49023 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PXNP49023 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PXNP49023 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PXNP49023 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PXNP49023 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PXNP49023 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PXNP49023 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PXNP49023 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PXNP49023 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PXNP49023 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PXNP49023 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PXNP49023 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXNP49023 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXNP49023 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXNP49023 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXNP49023 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXNP49023 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXNP49023 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXNP49023 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXNP49023 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXNP49023 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PXNP49023 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PXNP49023 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PXNP49023 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PXNP49023 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PXNP49023 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PXNP49023 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PXNP49023 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PXNP49023 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PXNP49023 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PXNP49023 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PXNP49023 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PXNP49023 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PXNP49023 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PXNP49023 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PXNP49023 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PXNP49023 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PXNP49023 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PXNP49023 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PXNP49023 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PXNP49023 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PXNP49023 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PXNP49023 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PXNP49023 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PXNP49023 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PXNP49023 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PXNP49023 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PXNP49023 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PXNP49023 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PXNP49023 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PXNP49023 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PXNP49023 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PXNP49023 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PXNP49023 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PXNP49023 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PXNP49023 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PXNP49023 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PXNP49023 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PXNP49023 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms