Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIP4K2AP48426 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms