Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS9P46781 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS9P46781 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS9P46781 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS9P46781 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS9P46781 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS9P46781 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS9P46781 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS9P46781 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS9P46781 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS9P46781 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS9P46781 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS9P46781 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS9P46781 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS9P46781 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS9P46781 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS9P46781 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS9P46781 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS9P46781 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS9P46781 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS9P46781 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS9P46781 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS9P46781 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS9P46781 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS9P46781 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS9P46781 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS9P46781 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS9P46781 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS9P46781 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS9P46781 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS9P46781 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS9P46781 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS9P46781 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS9P46781 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS9P46781 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS9P46781 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS9P46781 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS9P46781 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS9P46781 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS9P46781 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS9P46781 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS9P46781 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS9P46781 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS9P46781 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS9P46781 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS9P46781 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS9P46781 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS9P46781 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS9P46781 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS9P46781 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS9P46781 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS9P46781 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS9P46781 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS9P46781 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS9P46781 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS9P46781 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS9P46781 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS9P46781 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS9P46781 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS9P46781 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS9P46781 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS9P46781 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS9P46781 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms