Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms