Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 ERG20YJL167W 1059 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 GDA1YEL042W 1557 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 NRD1YNL251C 1728 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 RSC2YLR357W 2670 nt5.83□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 RPC53YDL150W 1269 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 MET16YPR167C 786 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 SSY5YJL156C 2100 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 MET12YPL023C 1974 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 LOS1YKL205W 3303 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 NMD3YHR170W 1557 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 HES1YOR237W 1305 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 YDR161WYDR161W 1164 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 MRS3YJL133W 945 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 AST1YBL069W 1290 nt5.82□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 ELP2YGR200C 2367 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 KCC4YCL024W 3114 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 THS1YIL078W 2205 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 VHS2YIL135C 1311 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 RML2YEL050C 1182 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 YOR379CYOR379C 339 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 CWH43YCR017C 2862 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 YIR007WYIR007W 2295 nt5.81□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 NTA1YJR062C 1374 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 CPR4YCR069W 957 nt5.8□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 ARC1YGL105W 1131 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 ADY3YDL239C 2373 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 STE20YHL007C 2820 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 SUL2YLR092W 2682 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 COA3YJL062W-A 258 nt5.79□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 AIM21YIR003W 2040 nt5.78□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 ARH1YDR376W 1482 nt5.78□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 UGA1YGR019W 1416 nt5.78□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 PCT1YGR202C 1275 nt5.78□□□□□ -1.48
YRF1-2P40105 HXK2YGL253W 1461 nt5.77□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 GCV1YDR019C 1203 nt5.76□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 HPM1YIL110W 1134 nt5.76□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 YLR296WYLR296W 327 nt5.76□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 AKL1YBR059C 3327 nt5.76□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 FRS1YLR060W 1788 nt5.76□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 YCL012CYCL012C 405 nt5.75□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 HAP1YLR256W 4509 nt5.75□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 IRC22YEL001C 678 nt5.75□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 SSB2YNL209W 1842 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 ASF2YDL197C 1578 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 YFT2YDR319C 825 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 CNN1YFR046C 1086 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 YJR096WYJR096W 849 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 BUB3YOR026W 1026 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 YPL162CYPL162C 822 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 GDB1YPR184W 4611 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 TFG1YGR186W 2208 nt5.74□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 COX4YGL187C 468 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 YPR109WYPR109W 885 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 RCK2YLR248W 1833 nt5.73□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 AAD4YDL243C 990 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 RMI1YPL024W 726 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 CPS1YJL172W 1731 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 MSC2YDR205W 2175 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt5.72□□□□□ -1.49
YRF1-2P40105 EGT2YNL327W 3126 nt5.71□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 RPL28YGL103W 450 nt5.71□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 RRB1YMR131C 1536 nt5.71□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 MGS1YNL218W 1764 nt5.71□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 SSL1YLR005W 1386 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 MCM1YMR043W 861 nt5.7□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 YER187WYER187W 426 nt5.69□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 YPR059CYPR059C 387 nt5.69□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 CDC28YBR160W 897 nt5.69□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 TRM11YOL124C 1302 nt5.69□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 RVB1YDR190C 1392 nt5.69□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 YDR282CYDR282C 1245 nt5.69□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 YIL165CYIL165C 360 nt5.69□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 YOR131CYOR131C 657 nt5.69□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 LSG1YGL099W 1923 nt5.68□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 HSP104YLL026W 2727 nt5.68□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 CNB1YKL190W 528 nt5.68□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 MRPL3YMR024W 1173 nt5.68□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 SGV1YPR161C 1974 nt5.68□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 UBX2YML013W 1755 nt5.68□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 RPB7YDR404C 516 nt5.67□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 RPL12AYEL054C 498 nt5.67□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 CDC12YHR107C 1224 nt5.67□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 YNL194CYNL194C 906 nt5.67□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 ARG82YDR173C 1068 nt5.66□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 YEL067CYEL067C 588 nt5.66□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 MIC26YGR235C 702 nt5.66□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 MAK3YPR051W 531 nt5.66□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 VAN1YML115C 1608 nt5.66□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 FAR10YLR238W 1437 nt5.66□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 STE7YDL159W 1548 nt5.66□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 PWP1YLR196W 1731 nt5.65□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 KRE29YER038C 1395 nt5.65□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 KIN2YLR096W 3444 nt5.65□□□□□ -1.5
YRF1-2P40105 YDL228CYDL228C 642 nt5.65□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 LSO1YJR005C-A 282 nt5.65□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 YNR065CYNR065C 3351 nt5.65□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 YPL245WYPL245W 1365 nt5.65□□□□□ -1.51
YRF1-2P40105 LDB19YOR322C 2457 nt5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.3 ms