Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	FAU1	YER183C	636 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YHR193C-A	YHR193C-A	375 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	GPP1	YIL053W	753 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	PUS5	YLR165C	765 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	CUE5	YOR042W	1236 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YCL021W-A	YCL021W-A	378 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	SUP35	YDR172W	2058 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	STP4	YDL048C	1473 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	KRS1	YDR037W	1776 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	COG1	YGL223C	1254 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YGR016W	YGR016W	573 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	PUS6	YGR169C	1215 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	BGL2	YGR282C	942 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	MTC2	YKL098W	1074 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	MRPL13	YKR006C	795 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	OST3	YOR085W	1053 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YTH1	YPR107C	627 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	RRB1	YMR131C	1536 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YEF1	YEL041W	1488 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	ECM7	YLR443W	1347 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	KAP114	YGL241W	3015 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YJL215C	YJL215C	360 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	NPT1	YOR209C	1290 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	MDR1	YGR100W	2853 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YNL247W	YNL247W	2304 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	RRP3	YHR065C	1506 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YTA12	YMR089C	2478 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	MEC3	YLR288C	1425 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	SYP1	YCR030C	2613 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	RHB1	YCR027C	630 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	MNN10	YDR245W	1182 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	RPL34A	YER056C-A	366 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	ERP5	YHR110W	639 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YJU2	YKL095W	837 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YAL044W-A	YAL044W-A	333 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	BUD17	YNR027W	954 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	FZO1	YBR179C	2568 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	AIM17	YHL021C	1398 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YGR266W	YGR266W	2106 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	RAD28	YDR030C	1521 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	HOT1	YMR172W	2160 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YGL036W	YGL036W	2730 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YCR006C	YCR006C	474 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	SUR2	YDR297W	1050 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	IPK1	YDR315C	846 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	TFB3	YDR460W	966 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YDR545C-A	YDR545C-A	480 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YEL077W-A	YEL077W-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YER190C-B	YER190C-B	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YFL068W	YFL068W	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	RPN12	YFR052W	825 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	SYF2	YGR129W	648 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YGR296C-B	YGR296C-B	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YHL050W-A	YHL050W-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YHR219C-A	YHR219C-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YIL177W-A	YIL177W-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YJL225W-A	YJL225W-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YLL066W-A	YLL066W-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YLL067W-A	YLL067W-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YLR466C-A	YLR466C-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YLR467C-A	YLR467C-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YML133W-B	YML133W-B	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YNL165W	YNL165W	1221 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YNL339W-B	YNL339W-B	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YBL113W-A	YBL113W-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YOR396C-A	YOR396C-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YPL283W-B	YPL283W-B	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YPR204C-A	YPR204C-A	483 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	HRR25	YPL204W	1485 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	MSE1	YOL033W	1611 nt		4.21	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	MCM4	YPR019W	2802 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	SAP155	YFR040W	3009 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	ARP2	YDL029W	1176 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	MHR1	YDR296W	681 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	NOP16	YER002W	696 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	BBP1	YPL255W	1158 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	RAD30	YDR419W	1899 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	SSB2	YNL209W	1842 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	YER158C	YER158C	1722 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	PUT1	YLR142W	1431 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	KDX1	YKL161C	1302 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	YDL172C	YDL172C	480 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	SRG1	SRG1	551 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	HSP82	YPL240C	2130 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	RCK2	YLR248W	1833 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SHE2	P36068	ISR1	YPR106W	1332 nt		4.2	□□□□□ -1.74

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