Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 YHL018WYHL018W 363 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 RFC2YJR068W 1062 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 HRT3YLR097C 1035 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 RPN7YPR108W 1290 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 FRS2YFL022C 1512 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 MKS1YNL076W 1755 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 VTH1YIL173W 4650 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 VTH2YJL222W 4650 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 ECM3YOR092W 1842 nt5.41□□□□□ -1.54
NIC96P34077 MTC1YJL123C 1437 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 AFT1YGL071W 2073 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 MAF1YDR005C 1188 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 SPO20YMR017W 1194 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 IRC14YOR135C 342 nt5.4□□□□□ -1.54
NIC96P34077 CLP1YOR250C 1338 nt5.4□□□□□ -1.55
NIC96P34077 ATG4YNL223W 1485 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 ESF1YDR365C 1887 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 snR63snR63 255 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YDR222WYDR222W 1248 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 GAL83YER027C 1254 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 SNZ3YFL059W 897 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YGL199CYGL199C 471 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 SIP2YGL208W 1248 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 ADH4YGL256W 1149 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YGR079WYGR079W 1113 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 MRP13YGR084C 1020 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 CUS2YNL286W 858 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 SNZ2YNL333W 897 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YNR040WYNR040W 771 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 APL6YGR261C 2430 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 ENT2YLR206W 1842 nt5.39□□□□□ -1.55
NIC96P34077 CDC19YAL038W 1503 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 ASF2YDL197C 1578 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 KNH1YDL049C 807 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YDL119CYDL119C 924 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 DCD1YHR144C 939 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 SFK1YKL051W 1062 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YLR049CYLR049C 1287 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 QRI5YLR204W 336 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YLR346CYLR346C 306 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 SPS4YOR313C 1017 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 MCM3YEL032W 2916 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 HFI1YPL254W 1467 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 MDL1YLR188W 2088 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 PRD1YCL057W 2139 nt5.38□□□□□ -1.55
NIC96P34077 NGR1YBR212W 2019 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 PTC1YDL006W 846 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 FYV1YDR024W 486 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YER010CYER010C 705 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 HPM1YIL110W 1134 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 RPS5YJR123W 678 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 FBP26YJL155C 1359 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 DIA3YDL024C 1407 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 MID1YNL291C 1647 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 SMF2YHR050W 1650 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YEH1YLL012W 1722 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 IME4YGL192W 1803 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 APM2YHL019C 1818 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 RRN3YKL125W 1884 nt5.37□□□□□ -1.55
NIC96P34077 VPS1YKR001C 2115 nt5.36□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YDR053WYDR053W 396 nt5.36□□□□□ -1.55
NIC96P34077 POR2YIL114C 846 nt5.36□□□□□ -1.55
NIC96P34077 VPS71YML041C 843 nt5.36□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YMR082CYMR082C 357 nt5.36□□□□□ -1.55
NIC96P34077 BUD8YLR353W 1812 nt5.36□□□□□ -1.55
NIC96P34077 RAD24YER173W 1980 nt5.36□□□□□ -1.55
NIC96P34077 HSP78YDR258C 2436 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YMR1YJR110W 2067 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 SIA1YOR137C 1869 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 KRS1YDR037W 1776 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 PDC1YLR044C 1692 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 KTR7YIL085C 1554 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 NGL2YMR285C 1548 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 DOT5YIL010W 648 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 IMD1YAR073W 1212 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 CIN4YMR138W 576 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 SNF3YDL194W 2655 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 PHO90YJL198W 2646 nt5.35□□□□□ -1.55
NIC96P34077 RFT1YBL020W 1725 nt5.34□□□□□ -1.55
NIC96P34077 LAP3YNL239W 1365 nt5.34□□□□□ -1.55
NIC96P34077 CLB5YPR120C 1308 nt5.34□□□□□ -1.55
NIC96P34077 IDP1YDL066W 1287 nt5.34□□□□□ -1.55
NIC96P34077 POP6YGR030C 477 nt5.34□□□□□ -1.55
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