Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja1P23242 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja1P23242 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja1P23242 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gja1P23242 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja1P23242 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja1P23242 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja1P23242 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja1P23242 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gja1P23242 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms