Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF7P17544 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF7P17544 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF7P17544 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF7P17544 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF7P17544 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF7P17544 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF7P17544 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF7P17544 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF7P17544 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF7P17544 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF7P17544 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF7P17544 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF7P17544 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF7P17544 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF7P17544 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF7P17544 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF7P17544 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF7P17544 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF7P17544 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF7P17544 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF7P17544 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF7P17544 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF7P17544 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF7P17544 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF7P17544 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF7P17544 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF7P17544 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF7P17544 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF7P17544 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF7P17544 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF7P17544 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF7P17544 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF7P17544 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF7P17544 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF7P17544 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF7P17544 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF7P17544 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF7P17544 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF7P17544 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATF7P17544 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF7P17544 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF7P17544 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATF7P17544 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF7P17544 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF7P17544 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF7P17544 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF7P17544 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF7P17544 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF7P17544 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF7P17544 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF7P17544 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF7P17544 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF7P17544 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF7P17544 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF7P17544 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF7P17544 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF7P17544 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF7P17544 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF7P17544 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF7P17544 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF7P17544 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF7P17544 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF7P17544 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF7P17544 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms