Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA1P17302 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA1P17302 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA1P17302 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA1P17302 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA1P17302 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA1P17302 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA1P17302 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA1P17302 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA1P17302 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA1P17302 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA1P17302 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA1P17302 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA1P17302 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA1P17302 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA1P17302 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA1P17302 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA1P17302 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA1P17302 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA1P17302 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA1P17302 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA1P17302 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA1P17302 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA1P17302 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA1P17302 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA1P17302 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA1P17302 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA1P17302 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA1P17302 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA1P17302 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA1P17302 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA1P17302 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA1P17302 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA1P17302 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA1P17302 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA1P17302 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA1P17302 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA1P17302 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA1P17302 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA1P17302 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA1P17302 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA1P17302 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA1P17302 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA1P17302 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA1P17302 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA1P17302 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA1P17302 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA1P17302 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA1P17302 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA1P17302 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA1P17302 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA1P17302 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA1P17302 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA1P17302 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA1P17302 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA1P17302 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA1P17302 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA1P17302 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA1P17302 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA1P17302 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA1P17302 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA1P17302 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA1P17302 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA1P17302 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA1P17302 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA1P17302 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA1P17302 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA1P17302 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA1P17302 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA1P17302 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA1P17302 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA1P17302 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA1P17302 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA1P17302 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA1P17302 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA1P17302 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA1P17302 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms