Protein–RNA interactions for Protein: P17081

RHOQ, Rho-related GTP-binding protein RhoQ, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOQP17081 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOQP17081 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOQP17081 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOQP17081 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOQP17081 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOQP17081 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOQP17081 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOQP17081 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOQP17081 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOQP17081 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOQP17081 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOQP17081 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOQP17081 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOQP17081 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOQP17081 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOQP17081 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOQP17081 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOQP17081 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOQP17081 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOQP17081 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOQP17081 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOQP17081 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOQP17081 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOQP17081 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOQP17081 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOQP17081 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOQP17081 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOQP17081 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOQP17081 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOQP17081 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOQP17081 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOQP17081 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOQP17081 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOQP17081 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOQP17081 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOQP17081 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOQP17081 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOQP17081 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOQP17081 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOQP17081 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOQP17081 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOQP17081 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOQP17081 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOQP17081 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOQP17081 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOQP17081 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOQP17081 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOQP17081 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOQP17081 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOQP17081 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOQP17081 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOQP17081 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOQP17081 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOQP17081 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOQP17081 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOQP17081 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOQP17081 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOQP17081 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOQP17081 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOQP17081 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOQP17081 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOQP17081 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOQP17081 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOQP17081 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOQP17081 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOQP17081 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms