Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB2P14652 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB2P14652 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB2P14652 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms