Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCANP13611 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCANP13611 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCANP13611 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VCANP13611 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCANP13611 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCANP13611 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VCANP13611 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCANP13611 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCANP13611 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCANP13611 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCANP13611 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VCANP13611 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCANP13611 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VCANP13611 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCANP13611 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VCANP13611 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VCANP13611 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VCANP13611 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCANP13611 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCANP13611 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCANP13611 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCANP13611 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCANP13611 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCANP13611 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCANP13611 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCANP13611 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCANP13611 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCANP13611 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VCANP13611 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCANP13611 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCANP13611 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCANP13611 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCANP13611 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCANP13611 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCANP13611 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCANP13611 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCANP13611 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VCANP13611 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCANP13611 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCANP13611 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCANP13611 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCANP13611 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCANP13611 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCANP13611 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCANP13611 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCANP13611 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCANP13611 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCANP13611 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCANP13611 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCANP13611 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCANP13611 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCANP13611 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCANP13611 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCANP13611 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCANP13611 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VCANP13611 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VCANP13611 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VCANP13611 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VCANP13611 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VCANP13611 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCANP13611 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCANP13611 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCANP13611 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VCANP13611 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCANP13611 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCANP13611 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms