Protein–RNA interactions for Protein: P11161

EGR2, E3 SUMO-protein ligase EGR2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR2P11161 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR2P11161 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR2P11161 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR2P11161 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR2P11161 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR2P11161 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR2P11161 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR2P11161 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR2P11161 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR2P11161 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR2P11161 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR2P11161 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR2P11161 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR2P11161 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR2P11161 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR2P11161 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR2P11161 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR2P11161 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR2P11161 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR2P11161 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR2P11161 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR2P11161 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR2P11161 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR2P11161 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR2P11161 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR2P11161 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR2P11161 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR2P11161 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR2P11161 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR2P11161 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR2P11161 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR2P11161 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR2P11161 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR2P11161 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR2P11161 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR2P11161 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR2P11161 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR2P11161 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR2P11161 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR2P11161 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR2P11161 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR2P11161 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGR2P11161 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms