Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFKMP08237 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFKMP08237 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFKMP08237 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFKMP08237 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PFKMP08237 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PFKMP08237 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKMP08237 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKMP08237 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKMP08237 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKMP08237 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKMP08237 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKMP08237 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKMP08237 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKMP08237 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKMP08237 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKMP08237 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKMP08237 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKMP08237 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKMP08237 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKMP08237 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKMP08237 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKMP08237 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKMP08237 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKMP08237 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKMP08237 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKMP08237 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKMP08237 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKMP08237 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKMP08237 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKMP08237 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKMP08237 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKMP08237 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFKMP08237 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PFKMP08237 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PFKMP08237 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFKMP08237 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFKMP08237 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFKMP08237 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PFKMP08237 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFKMP08237 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFKMP08237 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFKMP08237 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKMP08237 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKMP08237 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKMP08237 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKMP08237 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKMP08237 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFKMP08237 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFKMP08237 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKMP08237 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKMP08237 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKMP08237 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKMP08237 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKMP08237 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKMP08237 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKMP08237 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKMP08237 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKMP08237 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKMP08237 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKMP08237 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKMP08237 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKMP08237 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKMP08237 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKMP08237 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKMP08237 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKMP08237 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKMP08237 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKMP08237 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms