Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC1P01850 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBC1P01850 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBC1P01850 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms