Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAK4O96013 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAK4O96013 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAK4O96013 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAK4O96013 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAK4O96013 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK4O96013 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK4O96013 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK4O96013 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK4O96013 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK4O96013 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK4O96013 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK4O96013 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK4O96013 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK4O96013 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK4O96013 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK4O96013 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK4O96013 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK4O96013 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK4O96013 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK4O96013 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK4O96013 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK4O96013 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK4O96013 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK4O96013 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK4O96013 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK4O96013 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PAK4O96013 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAK4O96013 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAK4O96013 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAK4O96013 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAK4O96013 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAK4O96013 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAK4O96013 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK4O96013 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK4O96013 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK4O96013 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK4O96013 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK4O96013 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK4O96013 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK4O96013 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK4O96013 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK4O96013 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK4O96013 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK4O96013 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK4O96013 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK4O96013 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK4O96013 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK4O96013 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK4O96013 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK4O96013 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK4O96013 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK4O96013 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK4O96013 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK4O96013 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK4O96013 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK4O96013 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK4O96013 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK4O96013 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAK4O96013 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK4O96013 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK4O96013 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK4O96013 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK4O96013 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK4O96013 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK4O96013 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK4O96013 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK4O96013 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK4O96013 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms