Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMCC1O94876 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms