Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF6O75683 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF6O75683 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF6O75683 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SURF6O75683 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SURF6O75683 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SURF6O75683 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SURF6O75683 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SURF6O75683 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SURF6O75683 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SURF6O75683 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SURF6O75683 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SURF6O75683 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SURF6O75683 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SURF6O75683 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SURF6O75683 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SURF6O75683 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SURF6O75683 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SURF6O75683 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SURF6O75683 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SURF6O75683 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SURF6O75683 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SURF6O75683 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SURF6O75683 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SURF6O75683 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SURF6O75683 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SURF6O75683 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SURF6O75683 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SURF6O75683 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SURF6O75683 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SURF6O75683 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SURF6O75683 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SURF6O75683 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SURF6O75683 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SURF6O75683 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SURF6O75683 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SURF6O75683 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SURF6O75683 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SURF6O75683 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF6O75683 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF6O75683 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF6O75683 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF6O75683 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF6O75683 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF6O75683 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF6O75683 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF6O75683 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF6O75683 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF6O75683 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF6O75683 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF6O75683 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF6O75683 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF6O75683 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF6O75683 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF6O75683 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF6O75683 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SURF6O75683 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SURF6O75683 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SURF6O75683 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SURF6O75683 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SURF6O75683 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF6O75683 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF6O75683 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF6O75683 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF6O75683 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF6O75683 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF6O75683 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF6O75683 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF6O75683 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SURF6O75683 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SURF6O75683 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SURF6O75683 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SURF6O75683 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SURF6O75683 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SURF6O75683 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SURF6O75683 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SURF6O75683 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SURF6O75683 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SURF6O75683 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SURF6O75683 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SURF6O75683 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SURF6O75683 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SURF6O75683 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SURF6O75683 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SURF6O75683 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SURF6O75683 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SURF6O75683 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms