Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM3O75607 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM3O75607 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM3O75607 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM3O75607 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM3O75607 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM3O75607 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM3O75607 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM3O75607 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM3O75607 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM3O75607 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM3O75607 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM3O75607 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM3O75607 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM3O75607 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM3O75607 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM3O75607 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM3O75607 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM3O75607 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM3O75607 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM3O75607 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM3O75607 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM3O75607 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM3O75607 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM3O75607 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM3O75607 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM3O75607 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM3O75607 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM3O75607 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM3O75607 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM3O75607 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM3O75607 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM3O75607 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM3O75607 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM3O75607 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM3O75607 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM3O75607 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM3O75607 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM3O75607 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM3O75607 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM3O75607 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM3O75607 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM3O75607 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM3O75607 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM3O75607 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM3O75607 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM3O75607 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM3O75607 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM3O75607 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM3O75607 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM3O75607 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM3O75607 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM3O75607 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM3O75607 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM3O75607 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM3O75607 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPM3O75607 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPM3O75607 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPM3O75607 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPM3O75607 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPM3O75607 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPM3O75607 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPM3O75607 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPM3O75607 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPM3O75607 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPM3O75607 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPM3O75607 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPM3O75607 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NPM3O75607 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPM3O75607 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPM3O75607 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPM3O75607 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPM3O75607 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPM3O75607 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NPM3O75607 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPM3O75607 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPM3O75607 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPM3O75607 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms