Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSDE1O75534 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSDE1O75534 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms