Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUPL2O15504 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms