Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RIMBP2O15034 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RIMBP2O15034 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms