Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacna2d1O08532 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna2d1O08532 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms