Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MUA0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MUA0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MUA0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A8MUA0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MUA0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MUA0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MUA0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MUA0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MUA0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MUA0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MUA0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MUA0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MUA0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A8MUA0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A8MUA0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A8MUA0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MUA0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MUA0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MUA0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MUA0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MUA0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MUA0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MUA0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MUA0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A8MUA0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A8MUA0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A8MUA0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A8MUA0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A8MUA0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A8MUA0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A8MUA0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A8MUA0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A8MUA0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A8MUA0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MUA0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MUA0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MUA0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MUA0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MUA0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MUA0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MUA0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MUA0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MUA0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A8MUA0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MUA0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MUA0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MUA0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MUA0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MUA0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MUA0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A8MUA0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms