Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3P2A8K0S8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3P2A8K0S8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms