Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC69A6NI79 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC69A6NI79 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC69A6NI79 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms