Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIT2A6NDA9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIT2A6NDA9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms