Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM30A4D0T7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM30A4D0T7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMIM30A4D0T7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM30A4D0T7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms