Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms