Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms