Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL9Q9P2J3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL9Q9P2J3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms