Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms