Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms