Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms