Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms